Проведен
филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей спейсеров
хлоропластной рДНК (cpITS2-4) у 14 видов печеночников, 4 видов антоцеротовых,
20 видов мхов, 7 видов плауновидных и 2 видов харовых водорослей. Согласно
топологии филогенетических деревьев, реконструированных методами максимального
правдоподобия, ближайшего связывания и максимальной экономии, мохообразные не
монофилетичны. На кладограммах среди наземных растений первыми отделяются
ветви, ведущие к печеночникам. Мхи предстают как монофилетическая группа,
сестринская к кладе, объединяющей плауновидные и антоцеротовые. В нуклеотидной
последовательности cpITS3 у мхов обнаружена протяженная делеция, отсутствующая
у остальных наземных растений, включая Takakia.